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研究破解腫瘤微環(huán)境免疫治療耐藥的密碼

  腫瘤轉移環(huán)境是腫瘤細胞賴以生存的生態(tài)系統,腫瘤微環(huán)境的特征和類型與免疫治療的效果密切相關。腫瘤會通過遺傳突變“改造”其微環(huán)境特征,給自己打造一道免疫“屏障”,讓免疫治療的效果打折扣。

  近期,為了尋找腫瘤內在的遺傳突變與轉移瘤微環(huán)境特征,以及免疫治療關聯的“源頭”,破解“屏障”形成的機制,中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心等單位的科研人員建立了一種新型技術平臺——CLIM-TIME,揭示了腫瘤遺傳突變“改造”微環(huán)境進而導致免疫治療耐藥的基本規(guī)律,成功識別了能夠顯著提升免疫T細胞功效發(fā)揮及治療療效的靶點。

  研究團隊通過CLIM-TIME技術研究免疫細胞的組成及空間分布后,把391種常見腫瘤抑癌基因驅動形成的轉移瘤微環(huán)境,分成了7種類型。DNA損傷修復基因缺失形成的轉移瘤微環(huán)境,有大量免疫細胞“入駐”,腫瘤對免疫藥物特別“敏感”;而導致YAP激活的抑癌基因缺失,會形成“髓系細胞富集但T細胞排斥型”轉移瘤微環(huán)境,腫瘤對免疫藥物“反應遲鈍”,限制了免疫治療療效。

  為了“喚醒”對免疫藥物“無動于衷”的腫瘤,科研團隊以“髓系細胞富集但T細胞排斥型”轉移瘤微環(huán)境為研究對象,發(fā)現這類微環(huán)境中膠原蛋白過度沉積,并使腫瘤組織結構更加致密,阻礙T細胞進入腫瘤內部。

  圍繞如何攻破這道“屏障”,研究團隊鎖定了維持微環(huán)境“屏障”結構的一個關鍵分子——賴氨酸氧化酶樣蛋白2(LOXL2)。實驗表明,靶向LOXL2可顯著減少腫瘤中的膠原蛋白沉積,使被阻擋的T細胞能夠成功突破“屏障”,并順利進入腫瘤內部進行“殺傷”。在多種小鼠以及肺轉移瘤動物模型中,這一策略都成功增強了免疫治療的抗腫瘤效果。

  團隊進一步利用機器學習,找到了決定轉移瘤免疫狀態(tài)的因果基因,并構建了基于30個特征基因的準確預測免疫治療效果的模型。

  該研究首次在高通量尺度上建立了“腫瘤內在遺傳擾動—微環(huán)境結構—免疫治療效果”之間的因果聯系,為解析轉移瘤免疫治療耐藥提供了技術平臺。同時,新發(fā)現的微環(huán)境重塑分子,有望為解決轉移瘤耐藥難題提供新策略。

  相關研究成果在線發(fā)表在《細胞》(Cell)上。

基因突變塑造的免疫微環(huán)境特征及免疫功能解析

 

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