“活化石”魚類，指在漫長(zhǎng)的地質(zhì)歷史中，保持著極為古老且形態(tài)特征穩(wěn)定的物種，如矛尾魚、肺魚、雀鱔等。這些譜系通常經(jīng)歷了數(shù)億年的演化，但其形態(tài)、生態(tài)甚至基因組結(jié)構(gòu)卻變化緩慢，展現(xiàn)出遠(yuǎn)低于大多數(shù)現(xiàn)代魚類的演化速率。因此，它們保留了大量來自地質(zhì)歷史深處的生物學(xué)信息，是探索魚類多樣化進(jìn)程、脊椎動(dòng)物關(guān)鍵演化創(chuàng)新（例如水生到陸生的轉(zhuǎn)變）、以及基因組演化模式的重要研究對(duì)象。

　　日前，中國科學(xué)院水生生物研究所團(tuán)隊(duì)等，深入研究了雀鱔目魚類形態(tài)變化緩慢的基因組學(xué)機(jī)制并取得進(jìn)展。

　　團(tuán)隊(duì)基于鱷雀鱔與長(zhǎng)吻雀鱔的染色體級(jí)基因組，發(fā)現(xiàn)兩個(gè)屬魚類在染色體結(jié)構(gòu)上存在融合事件，并具有保守性。研究發(fā)現(xiàn)，兩個(gè)屬魚類在分化超過1億年后，依然有83.35%的基因組完全一致，且基因組大小差異大多數(shù)源于單堿基的插入/缺失，而非大規(guī)模結(jié)構(gòu)變化。研究進(jìn)一步指出，微染色體結(jié)構(gòu)比大染色體穩(wěn)定，且明顯富集于DNA修復(fù)與細(xì)胞凋亡相關(guān)基因，演化速率緩慢，染色體重排率僅約0.5次/百萬年。同時(shí)，兩個(gè)屬魚類與四足動(dòng)物的基因組相似度，甚至高于近緣的真骨魚類，且轉(zhuǎn)座元件的產(chǎn)生率與活躍度在脊椎動(dòng)物中最低，團(tuán)隊(duì)推測(cè)，其低活性是維持基因組穩(wěn)定性的重要原因。

　　白堊紀(jì)分化的兩個(gè)屬在現(xiàn)生環(huán)境中，仍可跨屬雜交并產(chǎn)生可存活后代。群體基因組分析顯示，兩個(gè)屬雖存在明顯的譜系分化，但歷史上仍有有限的基因流事件，這種持續(xù)的雜交能力或源于它們長(zhǎng)期的基因組結(jié)構(gòu)保守與低分子不相容性。

　　相關(guān)研究成果發(fā)表在《基因組研究》（Genome Research）上。

“活化石”魚類基因組演化研究獲進(jìn)展