2026年1月1日,中國(guó)科學(xué)院杭州醫(yī)學(xué)研究所構(gòu)建了全球首個(gè)融合單細(xì)胞分辨率與高通量測(cè)序的核酸適體篩選與動(dòng)力學(xué)分析平臺(tái)——SPARK-seq,為精準(zhǔn)分子識(shí)別、靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)及藥物遞送等領(lǐng)域提供了全新的研究工具與思路。
三陰性乳腺癌因其細(xì)胞表面缺乏類似HER2那樣明確的藥物作用靶點(diǎn),導(dǎo)致許多特效藥“無的放矢”,使臨床治療面臨巨大挑戰(zhàn)。
研究人員需要在根本上實(shí)現(xiàn)“雙突破”——既要為這類疾病快速找到關(guān)鍵靶點(diǎn),又要定制精準(zhǔn)的治療方案。傳統(tǒng)尋找新藥物靶點(diǎn)(“目標(biāo)”)和對(duì)應(yīng)治療分子(“鑰匙”)的方法效率低下,如同“大海撈針”。
SPARK-seq相當(dāng)于布下了一張“智能漁網(wǎng)”,其工作流程分為三步。第一步,利用CRISPR基因編輯技術(shù),對(duì)大量癌細(xì)胞進(jìn)行“微創(chuàng)手術(shù)”,使其表面不同的膜蛋白功能逐一缺失;同時(shí)引入包含海量候選分子的核酸適體庫(kù)。第二步,借助單細(xì)胞測(cè)序技術(shù),為每個(gè)細(xì)胞拍攝“高清全景照”,同步捕獲關(guān)鍵信息。第三步,通過開發(fā)新的算法和大數(shù)據(jù)分析,在海量數(shù)據(jù)中直接找出那些只牢牢結(jié)合在有癌變特征“目標(biāo)”上的“鑰匙”,并量化其結(jié)合的牢固程度。
這意味著,研究人員能在閉環(huán)系統(tǒng)中,同步發(fā)現(xiàn)新的疾病關(guān)鍵靶點(diǎn),并獲得能精準(zhǔn)作用于該靶點(diǎn)的潛在治療工具——核酸適配體,實(shí)現(xiàn)了“既發(fā)現(xiàn)鎖,又配好鑰匙”的一體化突破。SPARK-seq的研發(fā),使得高效、規(guī)模化地發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化靶向分子成為可能,為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域建立了快速研發(fā)平臺(tái)。
這一研究為三陰性乳腺癌等腫瘤帶來了新的治療希望,開創(chuàng)了強(qiáng)大的原創(chuàng)研發(fā)模式。未來或許能夠像查詢字典一樣,快速鎖定目標(biāo),并定制專屬的“特效鑰匙”。

SPARK-seq平臺(tái)用于核酸適體發(fā)現(xiàn)和變體設(shè)計(jì)
